鉴别培养基的原理是微生物的代谢产物与添加到培养基中的指示剂发生了显色反应，从而可以利用肉眼观察就可以将目标微生物与其他微生物区分开来。比如牛肉膏蛋白胨培养基就是典型的鉴别性培养基。